Кафедра оперативной хирургии и топографической анатомии была основана в 1938 году. Первым заведующим кафедрой был профессор М.К.Родионов. Приоритететными направлениями научной деятельности были изучение интрамуральной нервной системы, легочная хирургия.

С 1963 по 1988 годы кафедрой заведовал профессор А.Г.Коневский. Научными направлениями кафедры были: нейрогистология, бесшовное соединение сосудов, трансплантация органов. С 1988 по 1991 годы кафедрой заведовал профессор А.Г.Бебуришвили. Направлениями научной работы были хирургия портальной гипертензии, малоинвазивные хирургические вмешательства.

С 1991 года кафедрой заведует профессор Александр Александрович Воробьев.

Под научным руководством профессора А.А.Воробьева защищены 7 кандидатских диссертаций. В настоящее время выполняется 1 докторская и 12 кандидатских диссертаций. Профессор А.А.Воробьев автор более 200 научных работ, в их числе 2 монографии, 7 учебно-методических пособий, 14 авторских свидетельств и патентов на изобретения. На основе патентов на кафедре разработаны диагностические и лечебные технологии, которые нашли широкое применение в практическом здравоохранении. Целый ряд разработок кафедры касается экспериментальной хирургии.