В рамках Федеральных, отраслевых научно-исследовательских работ и 20 грантов различных фондов, полученных сотрудниками университета, в результате выполнения научных исследований получены следующие результаты:

• защищено 11 докторских и более 60 кандидатских диссертаций;
• издано 20 монографий;
• получено 10 патентов на изобретения;
• внедрено в практическое здравоохранение, в научный и учебный процессы 81 предложение;
• по результатам научных исследований издано 18 методических рекомендаций (из них 3 утверждено МЗиСР РФ);
• профессорско-преподавательский состав и научные сотрудники университета приняли участие в работе более чем 100 съездах, симпозиумах и конференциях различного уровня;
• опубликовано более 1000 статей в том числе и за рубежом;
• за лучшую научную работу студентов среди вузов Российской Федерации по разделу «медицинские науки» два студента университета награждены дипломами Министерства образования Российской Федерации.

• почетным дипломом лауреата IХ Конгреса Европейской Академии – Йожица И.
• дипломом на международном Конгрессе в Мексике – Землянская И.

• международный конгресс «Профилактика нарушений репродуктивного здоровья от профессиональных и экологических факторов риска»;
• международная стоматологическая конференция «Актуальные вопросы стоматологии»;
• Всероссийский симпозиум по эндотоксикозу;
• научно-практические конференции, посвященные различным актуальным вопросам медицины.

Сотрудники университета приняли участие в работе международной выставки «Инновационные разработки и передовые технологии» с новыми противовирсными препаратами, лекарственными и бальнеологическими средствами на основе бишофита, с новыми методами диагностики морфофункционального состояния стоп.

В 2005 году открылся седьмой диссертационный совет – КМ 208.008.04 по специальности 24.00.01 – история и теория культуры по историческим и философским наукам.

В диссертационных советах университета защитили 8 докторских и 79 кандидатских диссертаций.